SMPK Kolese Santo Yusup 1 berdiri pada tahun 1998 di bawah naungan Yayasan Pendidikan Kolese Santo Yusup. Didasari oleh kepedulian yang mendalam terhadap dunia pendidikan di Kota Malang, para pendiri sekolah bertekad untuk menciptakan institusi pendidikan menengah yang tidak hanya unggul secara akademis, tetapi juga berlandaskan pada nilai-nilai Kristiani dan semangat pengabdian.
Pada awal berdirinya, sekolah ini hanya menempati sebagian kecil bangunan dengan jumlah siswa yang terbatas. Namun, berkat dedikasi para pendidik dan dukungan penuh dari masyarakat sekitar, SMPK Kolese Santo Yusup 1 perlahan tumbuh menjadi salah satu sekolah menengah pertama swasta favorit di Malang.
Perkembangan & Era Modern
Memasuki era milenium baru, sekolah melakukan pembenahan besar-besaran, baik dari segi infrastruktur maupun kurikulum. Pembangunan gedung baru, penyediaan laboratorium modern, dan integrasi teknologi ke dalam ruang kelas menjadi tonggak penting dalam sejarah perkembangan sekolah.
Kini, SMPK Kolese Santo Yusup 1 telah meluluskan ribuan alumni yang tersebar di berbagai bidang profesi. Dengan semangat "Membangun Generasi SMART, Siap Hadapi Abad 21", sekolah terus berinovasi mengadaptasi kurikulum nasional dengan program-program unggulan demi menjawab tantangan masa depan.